新疆医院成立于年7月1日。年4月，医院成为医院；年9月，医院成为新疆医院。年11月，医院与新疆维吾尔自治区中医研究所合并,同时挂新疆维吾尔自治区中医药研究院、新疆医科大学第四临床医学院和新疆中医名医名方研究开发中心的牌子。60年的积淀，尤其是近十年来的快速发展，医院已成为全国规模较大、中西医人才汇聚、学科设置齐全、技术力量雄厚、中医特色突出、设备配套先进，集医疗、教学、科研、预防保健和康复于一医院。医院同时是国家中医临床研究基地、国家中医药优势特色教育培训基地、国家中药炮制传承基地、国家“中医药国际合作基地”、国家药物临床试验机构、国家卫生计生委关节镜诊疗技术培训基地、心血管疾病介入诊疗培训基地、脑卒中筛查与防治基地,并设有国家级博士后科研工作站。医院被国家发展改革委和国家中医药管理局确定为中医药传承医院项目建设单位。医院呼吸病研究实验室已成为新疆维吾尔自治区重点实验室，是新疆唯一一所自治区级呼吸病研究重点实验室。
医院设有86个临床医技科室，36个行*后勤科室，2个门诊部，1个社区卫生服务中心，1个分院，1个分部。年，医院门急诊总量达万人次；收治住院患者13.8万人次；完成手术4.5万台次；平均住院日9.7天。
医院始终坚持“以顾客为